《管理办法》主要分为总则、资金使用方向和支持方式、支持对象、拨付管理、监督管理及附则六部分，主要内容如下：
一、总则。重点介绍《管理办法》的出台背景、专项资金使用管理总体原则，明确主管单位的职责分工。
二、明确专项资金支持的六大方向。支持开展系列数字化服务活动、支持中小企业开展数字化改造、打造中小企业数字化转型样本企业、打造数字化车间和智能工厂等典型应用、探索“链式”数字化转型模式经验、提升数字化服务商服务能力等六大资金支持方向。
三、明确专项资金的支持对象及基本条件。支持对象须是依法登记注册，具有独立法人资格的中小企业、数字化专项服务商以及符合奖补范围的其他主体。
四、明确专项资金的拨付管理流程。包括第三方机构采购，企业申报补贴资金，样本企业、数字化车间、智能工厂、“链式”数字化转型典型模式和优质数字化服务商等流程。
五、明确了监督管理要求。专项资金使用管理接受审计、纪检监察、财政等部门的监督检查。资金申报主体须合规使用资金，配合绩效评价、监督检查及审计等工。
六、附则。对《管理办法》实施日期及有效期作出规定。